| 1 | Nacionalinių egzaminų centralizuota informacinė sistema NECIS | NECIS | Valstybės |
| 2 | Vilniaus universiteto studijų informacinė sistema | VUSIS | Kitas (vidaus administravimo) |
| 3 | Švietimo ir mokslo informacinių sistemų, registrų ir klasifikatorių apskaitos informacinė sistema | KRISIN | Kitas (vidaus administravimo) |
| 4 | Nesimokančių vaikų ir mokyklos nelankančių mokinių informacinė sistema | NEMIS | Valstybės |
| 5 | Paskolų studentams suteikimo, administravimo ir grąžinimo informacinė sistema | Paskola-3 | Žinybinis |
| 6 | Stipendijų ir finansinės paramos studentams informacinė sistema | PARAMA | Valstybės |
| 7 | Lietuvos mokslo ir studijų informacinė sistema / Institucijų mokslo ir studijų informacinė sistema | LieMSIS/IMSIS | Žinybinis |
| 8 | Atvira informavimo, konsultavimo ir orientavimo sistema (AIKOS) | AIKOS | Valstybės |
| 9 | Švietimo valdymo informacinė sistema | ŠVIS | Valstybės |
| 10 | Neformaliojo švietimo programų ir objektų virtualios mokymosi aplinkos informacinė sistema | VMAIS (SMIS) | Valstybės |
| 11 | Nacionalinio atviros prieigos mokslinių tyrimų duomenų archyvo informacinė sistema (MIDAS) | MIDAS | Valstybės |
| 12 | Bendrojo priėmimo informacinė sistema | BPIS (LAMA BPO) | Žinybinis |
| 13 | Lietuvos akademinės elektroninės bibliotekos informacinė sistema | eLABa | Valstybės |
| 14 | ŠMSM ir jai pavaldžių institucijų finansų valdymo ir apskaitos informacinė sistema | FVA | Kitas (vidaus administravimo) |
| 15 | Aukštųjų mokyklų studentų ir absolventų karjeros valdymo informacinė sistema | KVIS | Žinybinis |
| 16 | Mokslinių tyrimų ir eksperimentinės plėtros informacinė sistema | MTEPIS | Valstybės |
| 17 | Švietimo įstaigų (išskyrus aukštąsias mokyklas) vadovų informacinė sistema | VIKVIS | Kitas (vidaus administravimo) |
| 18 | Ugdymo turinio informacinė sistema | Ugdymo sodai | Žinybinis |
| 19 | Švietimo portalo informacinė sistema Emokykla | Švietimo portalo IS | Žinybinis |
